当一场矿难无情的降临在阿帕拉契山下的一座煤矿小城，三个迥然不同的当地人却因此莫名其妙地被卷入了复杂的秘密漩涡。阿莫斯·詹金斯，唯一的矿难幸存者，却成为调查过程的焦点。随着越来越多的对于谁来对这场灾难负责的疑问，一位煤矿高…

故事发生在2029年，彼时，X战警早已经解散，作为为数不多的仅存的变种人，金刚狼罗根和卡利班照顾着年迈的X教授，由于衰老，X教授已经丧失了对于自己超能力的控制，如果不依赖药物，他的超能力就会失控，在全球范围内制造无法挽回的灾难…

在不久的将来，疲惫的罗根隐居在墨西哥边境，照顾病重的X教授。因为一个年轻的变种人，罗根远离尘世、安享晚年的愿望破灭了。他再次被黑暗势力追逐。