故事讲述忍者 Kamui为了逃避自己的血腥过往，脱离忍者组织，隐姓埋名地生活着。然而由于他背叛了忍者古老的信条，一天夜晚，他的家人被前组织的暗杀者残忍杀害。为了给亲人复仇，Kamui重新化身为从前的自己。然而，二十一世纪的忍者是一…

眉难高中“地球防卫部”所属的两名社员由布院烟和鬼怒川热史，某天在澡堂泡澡的时候突然遇到了全身粉红的谜之生物“翁巴特”，请求他们帮忙守护地球。次日，潜入学校的翁巴特给防卫部的全员、以及一直追着翁巴特跑的一年级生箱根有基总共…